基于云計算的蛋白質折疊空間結構預測
所屬分類:技術論文
上傳者:wwei
文檔大小:3619 K
標簽: 云計算 蛋白質折疊 空間結構預測
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文檔介紹:構建基于云計算的蛋白質折疊空間結構預測框架,通過數據云存儲設備獲取蛋白質序列原始數據,采用HDFS(Hadoop Distributed File System)分布式存儲方式保存于云端。資源和隊列管理器RQM(Resource Queue Management)開啟云端虛擬機后,以之作為掃描節點(Sensor Node, SN),SN基于二維AB非格點模型建立最小蛋白質分子能量優化函數,采用局部搜索機制改進的量子遺傳算法對其作優化求解。利用云端GPU設備處理模型訓練數據,即可實現蛋白質折疊空間結構的自動化預測。實驗結果表明:蛋白質序列能量勢函數計算結果更小、執行效率更高、GDT-TS(Geothermal Development and Testing Tool Suite)評價指標值更大。
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